科学家发现DNA中癌症风险的标志 有助于锁定最有效靶点开发新疗法

作者:发布时间:2020-07-01 09:01

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经过为DNA润饰测序整个基因组,以及剖析癌症安排和健康安排,哈肯萨克市子午线卫生研讨人员和医师发现了或许导致癌症和其它疾病危险的要害因素: DNA特定方位中表达改动(甲基化)的失衡。

作者来自发现与立异中心(CDI),哈肯萨克大学医学中心及其John Theurer癌症中心(JTCC),以及国家癌症研讨所认可的乔治敦隆巴迪归纳癌症中心联盟,他们于6月29日在首要期刊《基因组生物学》上宣布了发现。 

最激烈的疾病相关基因变异在广泛的基因组扫描中很难定位,但经过在多种正常和癌安排扩大与这些DNA甲基化失衡相关的要害基因位点,科学家们陈述他们发现了有出路的新头绪,即更广泛的计算信号。

“咱们的等位基因特异性甲基化的密布图(基因变异导致的DNA甲基化失衡),将协助其他科学家把他们的作业重点放在与疾病相关的最相关的基因变异上。”该研讨的榜首作者、医学博士、CDI助理成员Catherine Do说,“由于咱们还深入研讨了这一现象的机制,以了解它是怎么导致疾病易理性的,咱们的研讨将有助于为个性化药物和药物开发确认新的风趣的生物学途径。” 

“癌细胞是恶棍,但在咱们的办法中,咱们让它们以一种有用的办法为咱们作业。”监督这项研讨的CDI试验室主任Benjamin Tycko医学博士说,“这些等位基因特异性甲基化的‘脚印’在癌症中比起在正常安排中更丰厚,但由于Catherine的研讨标明它们是由相同的生物学途径,咱们能够运用密布图了解癌症和非癌症的来历,非癌症疾病包含本身免疫性疾病、神经精神疾病和心脏代谢紊乱。”

现在的研讨产生了在这种办法中运用的最大的高质量数据集之一。在研讨的DNA样本中,有89名健康对照者的不同安排类型,还有来自JTCC肿瘤学家和外科医师医治的三种肿瘤的16个癌症样本:B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤和多形性胶质母细胞瘤(一种常见且难以医治的脑瘤)。

科学家们判定了15112个等位基因特异性甲基化位点,其间1838个位点处于全基因组相关研讨(GWAS)中疾病易理性计算信号邻近。这些数据现已揭露,以便其他科学家在GWAS后续研讨中测验新的假定。

在这项新发现中,该论文陈述了非编码骤变(不会改动蛋白质序列)的依据“或许经过对基因表达的长时间调控作用在癌症中发挥作用。”论文中引证的一个具体比如是TEAD1基因的等位基因特异性甲基化的骤变,依据显现,在侵袭性和难治性多发性骨髓瘤中,该基因过度表达。

另一个发现是,一些疾病相关的基因变异或许存在于“染色质沙漠,”即在可用安排类型中很少或没有特定生物信号的DNA方位,但这透露了等位基因特异性甲基化的脚印,且或许在细胞前史或发育阶段的不同时期活泼。

“这或许是确认癌症怎么开端的一个要害打破,给咱们一个更好的机会来抵挡它。” 论文作者之一、医学博士, CDI多发性骨髓瘤、淋巴瘤,多发性骨髓瘤研讨所开创董事David Siegel说,“在多发性骨髓瘤中,发现导致TEAD1等基因表观遗传激活的非编码骤变,或许有助于咱们确认最有期望的靶点,然后开发新的医治办法。”

“像这样的先进表观遗传学研讨将在不久的将来推进临床决议计划。”医学博士、医学硕士Andre Goy说,他是Hackensack Meridian健康中心肿瘤学的首席内科医师和John Theurer癌症中心主任,也是该论文的作者之一。“像这样的研讨,着眼于DNA甲基化和基因表达最具体的改变,能够协助咱们揭开癌症是怎么开端的谜题,或许还能协助咱们降服它。”

“我欣赏这一重要贡献,它有助于咱们了解癌症及其潜在的生物学,并有或许应用于其它疾病。” 乔治城大学隆巴迪归纳癌症中心和MedStar乔治城癌症研讨所的主任Louis M. Weiner博士说,“这项研讨发现进一步证明,将不同组织和专业的研讨人员集合在一起能够获得怎样的效果。”

编译/前瞻经济学人APP资讯组

原文来历:

https://medicalxpress.com/news/2020-06-scientists-uncover-signposts-dna-cancer.html

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-020-02059-3

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